耶和华吩咐摩西说：「你要为以色列人向米甸人报仇，然后归到你祖先那里。」他们遵照耶和华所吩咐摩西的，与米甸人打仗，杀了所有的男丁。在所杀的人中，他们杀了米甸的王，就是以未、利金、苏珥、户珥、利巴五个米甸的王，又用刀杀了比珥的儿子巴兰。
阅读民数记二十二至二十四章巴兰的故事，及二十五章巴力．毗珥事件，读者不禁会问：难道巴兰没事，就这样回老家去了？难道摩押人就这样船过水无痕？民数记三十一章就是回答这两个问题。这是在摩西过世以前重要的事，也是最后一场主要战争。在此先注意几个要点：
吩咐以色列民报仇：古近东战争多由君王发动，但是这一次却是由耶和华发动，因此不少人看这次战争是「圣战」。耶和华不会任凭罪恶存在蔓延，祂会处理，而且比人以为的更快、更严厉。祂吩咐摩西要去「为以色列民向米甸人报仇」（2节），更是「为耶和华向米甸人报仇」，原文意思是「将耶和华施行的报应加在米甸人身上」（3节）。
以色列民旗开得胜：以色列每一个支派都要派兵一千，一起向米甸人报仇，表示同仇敌忾，这乃是全民的争战。而派非尼哈祭司同去，且手里拿着圣所的器皿和吹号的号筒，表示这场战争不仅是全民的战争，有十二支派及利未支派，且耶和华自己也参与其中。果然以色列大获全胜，杀了米甸人所有男丁及米甸五个王，还有比珥的儿子巴兰，又掳获米甸妇女以及大批牛羊与财物。
灭绝已婚米甸女子：不料当以军凯旋而归，摩西却大怒，因为这些已婚的米甸妇女中不少人曾引诱以色列民犯罪，以致耶和华降灾，以致以色列民死了二万四千人。现在岂可再容留这些祸根呢？惟有处女得以留下，因为她们没有性经验，肯定没有参与巴力．毗珥的罪行。
思想：
许多人认为神要以色列人灭绝摩押/米甸人太过残忍而深感不妥。但从另一个角度来看，这不是单单针对外邦人，而是耶和华对于罪的一贯态度。严厉的刑罚是因为罪恶的可怕，正如耶和华降天火焚烧所多玛；以色列民在旷野屡次悖逆受罚（包括瘟疫、火蛇、金牛犊事件等）；以至出埃及的第一代仅有迦勒和约书亚得以进入应许之地，其他人包括摩西、亚伦和米利暗，全都因不信、背逆而倒毙在旷野。将来神的审判也会从神的家开始，这样我们更当何等慎重呢？
